国家生物医学实验细胞资源库西安分部的共建单位是空军军医大学国家分子医学转化中心/细胞生物学教研室，该中心位于陕西省西安市新城区空军军医大学基础医学院科研楼内，占地面积约4500m2，属于综合型教学、科研基地，同时中心还是细胞生物学国家重点学科、肿瘤生物学国家重点实验室骨干学科以及国家863计划西安细胞工程基地。
西安分部自2008年起参与国家细胞资源平台的建设运营，积累了大量的细胞保藏资源。分部细胞资源库管理运营按照国家细胞资源平台标准，建立了3级细胞库保藏系统，对各级细胞库细胞株构建、复苏、传代及冻存操作，按照国家细胞资源平台标准要求，建立了标准操作流程。在质量控制方面，细胞株按照标准技术流程完成无菌检测、支原体检测及STR检测等质控操作。细胞库进出库管理按照台账方式进行纸质及电子数据登记，并结合申领表格定期核准。目前库内保藏细胞株共计300余株，保藏总量近5000支。保藏细胞种类包括肿瘤细胞株1800余支，杂交瘤细胞株1700余支，其他工程细胞及基因改造细胞株900余支。此外，西安分部已建立针对工程细胞资源的多项应用技术平台，包括293F细胞瞬时蛋白表达平台、CHO细胞稳定细胞筛选表达平台、杂交瘤细胞制备平台、蛋白规模化制备纯化平台、流式细胞分选平台等。西安分部以科研课题为主要服务方向，可根据课题需求，进行包括资源保藏、鉴定、技术平台服务等多种服务，可针对性的满足不同重大科研课题服务需求。